GRUPOS DE INVESTIGACIÓN

Virología Humana

 

 

Biomedicina

Microbiología

RESUMEN

Nuestro grupo realiza estudios de epidemiología molecular para identificar y caracterizar nuevos virus en huéspedes humanos y animales de Argentina de acuerdo a los lineamientos de Una Salud, iniciativa internacional que promueve la interdependencia entre la salud humana y animal, y su vinculación con el medio ambiente. Para ello realizamos estudios interdisciplinarios que integran virología molecular, bioinformática, ecología, medicina humana, medicina veterinaria y epidemiología a fin de conocer y analizar la diversidad viral en distintos huéspedes y muestras biológicas a través de la aplicación de métodos moleculares convencionales desarrollados por el grupo y enfoques metagenómicos. El objetivo final es expandir el conocimiento sobre la filogenia, la taxonomía viral y la historia evolutiva de los nuevos genomas virales identificados, promover la vigilancia y la conservación, y facilitar el diagnóstico de aquellos virus que revistan interés para la salud humana y animal.
DIRECTOR/A DEL GRUPO
Giri, Adriana

Sede:

Facultad

Email:

giri@ibr-conicet.gov.ar
Directores/as de Proyecto
Investigadores/as Asociados/as
  • Bolatti,l Elisa María
BECARIOS/AS POST-DOCTORALES
BECARIOS/AS DOCTORALES
  • Cerri, Agustina
  • Di Domenica, Violeta
TESINISTAS
  • Garcia Rey, Julieta
TÉCNICOS/as
  • Bessone, María Celina

LÍNEA DE INVESTIGACIÓN

Epidemiología molecular de infecciones virales y desarrollo tecnológico para el diagnóstico

Realizamos estudios clínicos para caracterizar la epidemiología del virus del papiloma (PV) humano (HPV) en epitelios mucosos y su asociación con el desarrollo de lesiones benignas y malignas de la piel, interesándonos en la identificación y caracterización molecular de nuevos tipos. La familia Papillomaviridae es una de las más grandes y heterogéneas familias de virus que infectan organismos eucariotas cuyos miembros establecen distintas interacciones con el huésped, que van desde las infecciones asintomáticas hasta el cáncer. Para contribuir a la taxonomía y a completar la historia evolutiva de la familia Papillomaviridae extendimos nuestros estudios a animales silvestres de Argentina utilizando diversas herramientas metodológicas a fin de identificar y caracterizar nuevos tipos de distintos géneros y especies. Los ensayos desarrollados en el marco de estos proyectos han servido como plataforma para la creación de DETx MOL S.A. (https://www.detxmol.com.ar/) y se han extendido a otros virus agentes causantes de enfermedades humanas. Actualmente, estamos desarrollando un kit de detección de proteínas del SARS-CoV-2 utilizando aptámeros como sensores moleculares. En este contexto, la interacción del grupo de investigación con la empresa constituye un círculo virtuoso que incrementa y facilita las oportunidades de vinculación tecnológica de la academia con el sector productivo.

Enfoques metagenómicos para la identificación y análisis evolutivo de nuevos virus

El uso de las plataformas de secuenciamiento profundo combinado a programas de bioinformática ha acelerado el descubrimiento de nuevos virus en todos los ecosistemas, aportando nuevos paradigmas en la taxonomía viral y cambiando la percepción de los virus como fuentes de amenazas mortales hacia potenciales actores determinantes en el bienestar humano y animal.

Utilizamos estas herramientas para responder a distintas problemáticas que incluyen: 1) la caracterización del viroma de muestras biológicas no invasivas recolectadas de animales silvestres de Argentina con el objetivo de descubrir nuevos virus, contribuir a la taxonomía viral, a la vigilancia de virus zoonóticos y a la conservación de especies amenazadas; 2) estudios de vigilancia genómica del SARS-CoV-2 en distintas plataformas de secuenciación para conocer las variantes circulantes en el sur de la provincia de Santa Fe y sus historias evolutivas en respuesta a la pandemia de COVID-19, como grupo integrante del Proyecto PAIS (http://pais.qb.fcen.uba.ar/); 3) la caracterización del viroma cutáneo en la salud (piel sana) y en la enfermedad (psoriasis) en pacientes que asisten al Hospital Provincial del Centenario de Rosario a través de la realización de un estudio de casos y controles con el objetivo de explorar potenciales factores de riesgo que desencadenen el desarrollo de la enfermedad y/o promuevan la exacerbación de las lesiones.

IMÁGENES DE NUESTRAS INVESTIGACIONES

Descripción general de las estrategias aplicadas para el descubrimiento de nuevos virus.
Descripción general de las estrategias aplicadas para el descubrimiento de nuevos virus.
Mapas genéricos de los genomas de seis familias virales identificadas en muestras fecales de cinco especies de murciélagos de Argentina usando metagenómica. Los genomas lineales y circulares se representan como una línea y círculos, respectivamente. Los marcos de lectura abiertos y otras características genómicas se muestran como bandas de colores; la dirección de los marcadores de flecha indica la hebra genómica en la que se encuentran dichas características.
Mapas genéricos de los genomas de seis familias virales identificadas en muestras fecales de cinco especies de murciélagos de Argentina usando metagenómica. Los genomas lineales y circulares se representan como una línea y círculos, respectivamente. Los marcos de lectura abiertos y otras características genómicas se muestran como bandas de colores; la dirección de los marcadores de flecha indica la hebra genómica en la que se encuentran dichas características.

PUBLICACIONES Y PATENTES

Viral Metagenomic Data Analyses of Five New World Bat Species from Argentina: Identification of 35 Novel DNA Viruses.

Microorganisms. 10(2),266. Bolatti, E. M., Viarengo, G., Zorec, T. M., Cerri, A., Montani, M. E., Hosnjak, L., Casal, P. E., Bortolotto, E., Di Domenica, V., Chouhy, D., Allasia, M. B., Barquez, R. M., Poljak, M., and Giri, A. A. (2022).

Viral Metagenomic Data Analyses of Five New World Bat Species from Argentina: Identification of 35 Novel DNA Viruses.

Microorganisms. 10(2),266. Bolatti, E. M., Viarengo, G., Zorec, T. M., Cerri, A., Montani, M. E., Hosnjak, L., Casal, P. E., Bortolotto, E., Di Domenica, V., Chouhy, D., Allasia, M. B., Barquez, R. M., Poljak, M., and Giri, A. A. (2022).
Más información

Cost-Effective Method to Perform SARS-CoV-2 Variant Surveillance: Detection of Alpha, Gamma, Lambda, Delta, Epsilon, and Zeta in Argentina.

Front Med (Lausanne). 8,755463. Torres, C, Mojsiejczuk, L., Acuña, D., Alexay, S., Amadio, A., Aulicino, P., Debat, H., Fay, F., Fernández, F., Giri, A. A., et al. (2021).

Cost-Effective Method to Perform SARS-CoV-2 Variant Surveillance: Detection of Alpha, Gamma, Lambda, Delta, Epsilon, and Zeta in Argentina.

Front Med (Lausanne). 8,755463. Torres, C, Mojsiejczuk, L., Acuña, D., Alexay, S., Amadio, A., Aulicino, P., Debat, H., Fay, F., Fernández, F., Giri, A. A., et al. (2021).
Más información

A Preliminary Study of the Virome of the South American Free-Tailed Bats (Tadarida brasiliensis) and Identification of Two Novel Mammalian Viruses.

Viruses. 12,422. Bolatti, E. M., Zorec, T. M., Montani, M. E., Hošnjak, L., Chouhy, D., Viarengo, G., Casal, P.E., Barquez, R.M., Poljak, M. and Giri, A.A. (2020).

A Preliminary Study of the Virome of the South American Free-Tailed Bats (Tadarida brasiliensis) and Identification of Two Novel Mammalian Viruses.

Viruses. 12,422. Bolatti, E. M., Zorec, T. M., Montani, M. E., Hošnjak, L., Chouhy, D., Viarengo, G., Casal, P.E., Barquez, R.M., Poljak, M. and Giri, A.A. (2020).
Más información

Assessing Gammapapillomavirus infections of mucosal epithelia with two broadspectrum PCR protocols.

BMC Infectious Diseases. 20,274. Bolatti, E. M., Hošnjak, L., Chouhy, D., Casal, P. E., Re-Louhau, M. F., Bottai, H., Fujs Komloš, K., Poljak, M. and Giri, A. A. (2020).

Assessing Gammapapillomavirus infections of mucosal epithelia with two broadspectrum PCR protocols.

BMC Infectious Diseases. 20,274. Bolatti, E. M., Hošnjak, L., Chouhy, D., Casal, P. E., Re-Louhau, M. F., Bottai, H., Fujs Komloš, K., Poljak, M. and Giri, A. A. (2020).
Más información

High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type.

Virology. 525,182-191. Bolatti, E. M., Hošnjak, L., Chouhy, D., Re-Louhau, M. F., Casal, P. E., Bottai, H., Kocjan, B. J., Stella, E. J., Gorosito, M. D., Sanchez, A., Fernandez-Bussy, R., Poljak, M, Giri, A. A. (2018).

High prevalence of Gammapapillomaviruses (Gamma-PVs) in pre-malignant cutaneous lesions of immunocompetent individuals using a new broad-spectrum primer system, and identification of HPV210, a novel Gamma-PV type.

Virology. 525,182-191. Bolatti, E. M., Hošnjak, L., Chouhy, D., Re-Louhau, M. F., Casal, P. E., Bottai, H., Kocjan, B. J., Stella, E. J., Gorosito, M. D., Sanchez, A., Fernandez-Bussy, R., Poljak, M, Giri, A. A. (2018).
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9 Oct

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