Otras Líneas de Investigación

Estructuras no canónicas de los ácidos nucleicos en el control de la expresión génica normal y patológica

RESUMEN

Estudiamos la regulación de genes a través de mecanismos novedosos y poco explorados que dependen de estructuras no convencionales de los ácidos nucleicos (ADN y ARN), conocidas como cuádruplex de guanina o G4. Estos mecanismos fueron revelados en los últimos 20 años para todos los organismos vivos, desde animales y plantas a microorganismos como las bacterias e incluso en virus con material genético de ADN y ARN. El proyecto estudia los G4 en el control de genes relacionados con el desarrollo embrionario animal, utilizando al pez cebra como modelo. También investigamos la función de los G4 en la regulación de genes relacionados con patologías humanas, principalmente involucrados con el cáncer, y la influencia de variaciones genéticas en los G4 como posibles causas para la predisposición o establecimiento de dichas patologías. Además, recientemente se incorporó el estudio de la función de los G4 en la biología y replicación del virus SARS-CoV-2, causante de la pandemia de COVID-19.

DIRECTOR/A DEL GRUPO
Pablo Armas

Email:

armas@ibr-conicet.gov.ar
BECARIOS/AS DOCTORALES
Lorenzatti, Agustín
Bezzi, Georgina
Bayon, Candela
BECARIOS/AS POST DOCTORALES
Baranoski, Adrivaino
tesinistas
Diedrich, Lucas

IMÁGENES DE NUESTRAS INVESTIGACIONES

We search for human short genetic variants occurring in G-quadruplexes within promoters, demonstrating that they alter gene transcription and may be responsible for the onset of diseases.
We search for human short genetic variants occurring in G-quadruplexes within promoters, demonstrating that they alter gene transcription and may be responsible for the onset of diseases.
We study the role of G-quadruplexes in the regulation of the biogenesis of microRNAs, a type of small RNA with functions in regulating gene expression at the post-transcriptional level. For this, we use different bioinformatic analyzes (in silico), in vitro experiments and in vivo functional assays in zebrafish embryonic development.
We study the role of G-quadruplexes in the regulation of the biogenesis of microRNAs, a type of small RNA with functions in regulating gene expression at the post-transcriptional level. For this, we use different bioinformatic analyzes (in silico), in vitro experiments and in vivo functional assays in zebrafish embryonic development.

PUBLICACIONES Y PATENTES

Genetic variations in G-Quadruplex forming sequences affect the transcription of human disease-related genes.

bioRxiv. 2022.08. 16.503999. Lorenzatti, A., Piga, E. J., Gismondi, M., Binolfi, A., Margarit, E., Calcaterra, N. B., Armas, P. (2023).

Genetic variations in G-Quadruplex forming sequences affect the transcription of human disease-related genes.

bioRxiv. 2022.08. 16.503999. Lorenzatti, A., Piga, E. J., Gismondi, M., Binolfi, A., Margarit, E., Calcaterra, N. B., Armas, P. (2023).
DOI

G-quadruplexes regulate miRNA biogenesis in live zebrafish embryos.

International Journal of Molecular Sciences. 24(5), 4828. Steeman, T. J., Weiner A. M. J., David, A. P., Binolfi, A., Calcaterra, N. B., Armas, P. (2023).

G-quadruplexes regulate miRNA biogenesis in live zebrafish embryos.

International Journal of Molecular Sciences. 24(5), 4828. Steeman, T. J., Weiner A. M. J., David, A. P., Binolfi, A., Calcaterra, N. B., Armas, P. (2023).
DOI

CNBP binds and unfolds in vitro G-quadruplexes formed in the SARS-CoV-2 positive and negative genome strands.

International Journal of Molecular Sciences. 22(5), 2614. Bezzi, G., Piga, E. J., Binolfi, A., Armas, P. (2021).

CNBP binds and unfolds in vitro G-quadruplexes formed in the SARS-CoV-2 positive and negative genome strands.

International Journal of Molecular Sciences. 22(5), 2614. Bezzi, G., Piga, E. J., Binolfi, A., Armas, P. (2021).
DOI

CNBP controls transcription by unfolding DNA G-quadruplex structures.

Nucleic Acids Research. 47(15), 7901-7913. David, A. P., Pipier, A., Pascutti, F., Binolfi, A., Weiner, A. M. J., Challier, E., Heckel, S., Calsou, P., Gomez, D., Calcaterra, N. B., Armas, P. (2019).

CNBP controls transcription by unfolding DNA G-quadruplex structures.

Nucleic Acids Research. 47(15), 7901-7913. David, A. P., Pipier, A., Pascutti, F., Binolfi, A., Weiner, A. M. J., Challier, E., Heckel, S., Calsou, P., Gomez, D., Calcaterra, N. B., Armas, P. (2019).
DOI

G-quadruplexes as novel cis-elements controlling transcription during embryonic development.

Nucleic Acids Research. 44(9), 4163-4173. David, A. P., Margarit, E., Domizi, P., Banchio, C., Armas, P., Calcaterra, N. B. (2016).

G-quadruplexes as novel cis-elements controlling transcription during embryonic development.

Nucleic Acids Research. 44(9), 4163-4173. David, A. P., Margarit, E., Domizi, P., Banchio, C., Armas, P., Calcaterra, N. B. (2016).
DOI

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https://www.scopus.com/authid/detail.uri?authorId=6506870338

https://orcid.org/0000-0002-0454-1424